Mảng vi mạch (microarray) là một con chip được phủ hàng ngàn điểm nhỏ li ti chứa DNA hoặc protein. Mỗi điểm tương ứng với một gen hoặc protein cụ thể. Khi một mẫu được đưa vào, các phân tử trong mẫu sẽ liên kết với các điểm bổ sung của chúng. Lượng liên kết được đo lường, cho phép xem xét nhanh chóng mức độ biểu hiện gen hoặc protein trên hàng ngàn mục tiêu cùng một lúc. Công nghệ này đã tạo nên một cuộc cách mạng khi xuất hiện vào cuối những năm 1990.

Loại phổ biến nhất là vi mảng DNA. Nó có thể đo lường sự biểu hiện của mọi gen trong bộ gen chỉ trong một thí nghiệm. Nó cũng có thể phát hiện các biến thể di truyền, như đa hình nucleotide đơn và thay đổi số lượng bản sao. Vi mảng protein đo lường mức độ và sự tương tác của protein. Vi mảng mô cho phép các nhà bệnh lý học phân tích nhiều mẫu mô trên một lam kính.

Kỹ thuật microarray phần lớn đã được thay thế bằng giải trình tự RNA trong các nghiên cứu biểu hiện gen, vì giải trình tự nhạy hơn và có thể phát hiện các bản sao RNA mới. Tuy nhiên, microarray vẫn hữu ích cho việc xác định kiểu gen với số lượng lớn, chẩn đoán lâm sàng và các ứng dụng mà chi phí là yếu tố quan trọng. Chúng cũng được sử dụng trong nghiên cứu để xác thực kết quả giải trình tự.

Công nghệ này đã hoàn thiện và được sử dụng rộng rãi. Nó đòi hỏi thiết kế thí nghiệm và phân tích dữ liệu cẩn thận. Một thí nghiệm microarray có thể tạo ra lượng dữ liệu nhiều hơn khả năng phân tích của một phòng thí nghiệm đơn lẻ, đó là lý do tại sao tin sinh học lại rất cần thiết.