Un microarray este un cip acoperit cu mii de pete minuscule de ADN sau proteină. Fiecare punct corespunde unei gene sau proteine ​​specifice. Când se aplică o probă, moleculele din probă se leagă de punctele lor complementare. Se măsoară cantitatea de legare, oferind o imagine de ansamblu asupra expresiei genelor sau a nivelurilor de proteine ​​în mii de ținte simultan. Tehnologia a fost o revoluție când a apărut la sfârșitul anilor 1990.

Cel mai comun tip este microarray-ul de ADN. Acesta poate măsura expresia fiecărei gene dintr-un genom într-un singur experiment. De asemenea, poate detecta variații genetice, cum ar fi polimorfismele cu un singur nucleotid și modificările numărului de copii. Microarray-urile de proteine ​​măsoară nivelurile și interacțiunile proteinelor. Microarray-urile de țesuturi permit patologilor să analizeze mai multe probe de țesut pe o singură lamă.

Microarray-urile au fost în mare parte înlocuite de secvențierea ARN-ului pentru studiile de expresie genică, deoarece secvențierea este mai sensibilă și poate detecta transcrieri noi. Însă microarray-urile rămân utile pentru genotiparea de mare randament, diagnosticarea clinică și aplicațiile în care costul contează. De asemenea, sunt utilizate în cercetare pentru a valida rezultatele secvențierii.

Tehnologia este matură și disponibilă pe scară largă. Necesită un design experimental atent și o analiză atentă a datelor. Un experiment cu microarray poate genera mai multe date decât poate interpreta un singur laborator, motiv pentru care bioinformatica este esențială.