Genom memberi tahu Anda protein apa yang dapat dibuat. Proteomik memberi tahu Anda protein apa yang sebenarnya ada. Ini adalah studi skala besar tentang protein, termasuk ekspresi, modifikasi, interaksi, dan fungsinya. Protein adalah komponen penting sel, dan kadarnya berubah sebagai respons terhadap penyakit, obat-obatan, dan lingkungan. Proteomik menangkap keadaan dinamis tersebut.

Bidang ini bergantung pada spektrometri massa dan teknik pemisahan. Sampel dicerna menjadi peptida, dipisahkan dengan kromatografi cair, dan dianalisis dengan spektrometri massa. Spektrum yang dihasilkan dicocokkan dengan basis data protein untuk mengidentifikasi dan mengkuantifikasi protein. Ribuan protein dapat dideteksi dalam satu percobaan. Modifikasi pasca-translasi, seperti fosforilasi dan glikosilasi, juga dapat dipetakan.

Proteomik digunakan untuk menemukan biomarker penyakit, memahami mekanisme obat, dan mempelajari interaksi protein. Dalam penelitian kanker, proteomik digunakan untuk mengidentifikasi protein yang mendorong pertumbuhan tumor. Dalam mikrobiologi, proteomik digunakan untuk mempelajari bagaimana patogen merespons antibiotik. Dalam pertanian, proteomik digunakan untuk meningkatkan toleransi tanaman terhadap stres.

Tantangannya bersifat teknis. Protein sangat bervariasi dalam kelimpahannya, dari jutaan salinan per sel hingga hanya beberapa. Protein dengan kelimpahan rendah sulit dideteksi. Datanya kompleks, dan interpretasinya membutuhkan bioinformatika. Namun, proteomik semakin berkembang, dan melengkapi genomik dan transkriptomik untuk memberikan gambaran biologi yang lebih lengkap.