तंत्रिका तंत्र से कंकाल की मांसपेशियों तक जाने वाला अंतिम सामान्य मार्ग मोटर न्यूरॉन है। इसका कोशिका शरीर रीढ़ की हड्डी या मस्तिष्क स्टेम में स्थित होता है; इसका एक्सॉन एक वेंट्रल रूट या कपाल तंत्रिका के माध्यम से बाहर निकलता है और न्यूरोमस्कुलर जंक्शन पर मांसपेशी तंतुओं से जुड़ जाता है।

एक मोटर न्यूरॉन और उससे जुड़े मांसपेशी तंतुओं को मिलाकर एक मोटर इकाई बनती है। छोटी मोटर इकाइयाँ सूक्ष्म नियंत्रण प्रदान करती हैं; बड़ी इकाइयाँ अधिक बल उत्पन्न करती हैं। मोटर न्यूरॉन सक्रिय होने का निर्णय लेने से पहले संवेदी अभिवाही तंत्रिकाओं, अंतर्न्यूरॉनों और अवरोही मार्गों से प्राप्त संकेतों को एकीकृत करते हैं। उनकी सक्रियता दर और सक्रियण क्रम मांसपेशी संकुचन के बल और समय को निर्धारित करते हैं।

मोटर न्यूरॉन्स के क्षय से एमियोट्रॉफिक लेटरल स्क्लेरोसिस और संबंधित बीमारियों में धीरे-धीरे कमजोरी बढ़ती है। न्यूरोमस्कुलर जंक्शन पर विषाक्त पदार्थ और ऑटोइम्यून हमले भी मोटर आउटपुट को प्रभावित करते हैं। मोटर न्यूरॉन्स बड़े और आसानी से सुलभ होने के कारण, उत्तेजना, सिनैप्टिक संचरण और रोग तंत्र के अध्ययन के लिए मॉडल कोशिकाओं के रूप में उपयोग किए जाते रहे हैं।

प्रत्येक स्वैच्छिक गतिविधि अंततः इन कोशिकाओं के विश्वसनीय रूप से सक्रिय होने पर निर्भर करती है।